Araştırmacılar, enfeksiyonları teşhis etmek için “tek duraklı bir dükkan” dedikleri şeyi yarattılar – tek bir damla kanı tarayarak bireyin tam viral geçmişini belirleyebilen bir test.
VirScan adlı test Stephen Elledge ve Howard Hughes Tıp Enstitüsü’nden (HHMI) çalışanlar tarafından yaratıldı.
Elledge, “İnsanların [kan] serumlarında zaman içinde geriye bakmak ve hangi virüslerin yaşadıklarını görmek için bir tarama metodolojisi geliştirdik” diye açıklıyor. “Her seferinde tek bir virüs için test yapmak yerine, emek yoğun olduğu için bunların hepsini bir kerede test edebiliriz. Tek seferlik alışveriş.”
Ekip, VirScan’ın dergide yayınlanan yeni bir çalışmada nasıl çalıştığını açıklıyor ve bu testte, testin, belirli virüslerle enfekte olan 500’den fazla katılımcının kan örnekleri üzerinde test edildiğinde nasıl ortaya çıktığını da açıklıyor.
Elledge ve arkadaşları, testi oluşturmak için 93.000’in üzerinde kısa DNA parçasını sentezlemişlerdir; her bölüm, çeşitli viral protein parçalarını kodlayan peptitler olarak adlandırılmıştır.
Daha sonra ekip, bakteriyel fazlara bulaşan ve onları enfekte eden virüsler olan bakteriyofajlara DNA bölümlerini tanıttı. Her bir bakteriyofaj, bir peptid ile kalıplanmış, peptit, bakteriyofajın yüzeyi üzerinde gösterilmektedir.
Birlikte, bakteriyofajlar, şu anda bilinen 1000’den fazla insan virüsü suşunda mevcut olan tüm protein dizilerini göstermektedir.
VirScan’ın kan örneklerinde virüsleri nasıl tanımladığını açıklayan araştırmacılar, kanda bulunan antiviral antikorların, her bir bakteriyofajın yüzeyindeki peptitlerde bulunan epitoplar olarak bilinen benzersiz özellikleri fark ettiklerini belirtiyorlar. Bakteriyofajlar bir kan örneği ile birleştirildiğinde, kandaki antikorlar bu epitoplara bağlanır ve bağlanır.
Araştırmacılar daha sonra bu antikorları toplarlar ve bağlandıkları bakteriyofajlar hariç her şeyi bertaraf ederler.
Bu bakteriyofajlar üzerinde DNA dizilimi gerçekleştirerek, ekip, antikorların birbirine yapıştığı peptidleri tanımlayarak, bir bireyin bağışıklık sisteminin hangi virüslere bulaştığını, enfeksiyon veya aşılama yoluyla ortaya koyabilir.
EllSege’e göre, VirScan’ın 100 kan örneğini analiz etmesi yaklaşık 2-3 gün sürecek, ancak bu işlem süresinin daha fazla geliştirileceğinden emin olabilir. Bir kan örneğini analiz etmek için 25 dolara mal olur.
Test yüksek duyarlılık ve özgüllük gösterdi
Araştırmacılar VirScan’ı ABD, Güney Afrika, Tayland ve Peru’dan alınan 569 kişinin kan numuneleri üzerinde test ettiler. Bunların hepsi, insan immün yetmezlik virüsü (HIV) ve hepatit C gibi bazı virüslerle enfekte olduğu biliniyordu.
Genel olarak, VirScan, ekibine göre, çok doğru sonuçlar üreten test ile, kan örneklerinden antikorlar ve epitoplar arasındaki yaklaşık 100 milyon olası etkileşimi analiz etti. Elledge diyor ki:
“HIV ve hepatit C için% 95-100 hassasiyet aralığındaydık ve özgüllük iyiydi – negatif olan insanları yanlış bir şekilde tanımlamadık. Bu bize diğer virüsleri tespit edebileceğimize dair güven verdi.” Onları gerçek olduklarını bildiğimizi gördük. “
Ekip, araştırmaya dahil edilen her bireyin ortalama 10 farklı virüse sahip olduğunu, Güney Afrika, Peru ve Tayland’daki insanların ABD’deki virüslerden daha fazla virüslere karşı antikorlara sahip olduğunu buldu.
Buna ek olarak, yetişkinlerin çocuklardan daha fazla virüslere karşı antikorlara sahip olduklarını ve HIV’li kişilerin HIV virüsü olmayanlara göre daha fazla virüs antikorlarına sahip olduklarını bulmuşlardır.
Bununla birlikte, belki de en şaşırtıcı bulgu, bazı virüslere karşı antikor tepkilerinin her bir kişide benzer olduğu bulunmuştur; Farklı insanların antikorları, spesifik virüslerin peptidlerinde bulunan tam olarak aynı amino asitleri tanıdı.
Araştırmacılar VirScan’ın belirli virüsleri tek tek test eden mevcut viral test yöntemlerine etkili bir alternatif olabileceğinden emin.
Test, bir bireyin viral geçmişini belirleyebileceğinden, ekip, gözden kaçmış olabilecek sağlığı etkileyen faktörleri ortaya çıkarma potansiyeline sahip olduğuna inanmaktadır. Test ayrıca, geniş popülasyonlardaki viral enfeksiyonları değerlendirme ve karşılaştırma fırsatı sunmakta ve hatta aşı tasarımı için etkileri olabilir.
Araştırmacılar, araştırmacıların, VirScan’ın doğruluğunu geliştirmelerine yardımcı olduğunu ve daha fazla araştırma ile daha da gelişeceğini umuyorlar.
VirScan’ı yaratmak için kullanılan yaklaşım, bağışıklık sisteminin vücudun sağlıklı dokularına saldırdığı, otoimmün hastalıklarla ilgili olanlar gibi diğer antikorları tanımlamak için de uygulanabilir.
